TY - JOUR T1 - Cell specific eQTL analysis without sorting cells JF - bioRxiv DO - 10.1101/002600 SP - 002600 AU - Harm-Jan Westra AU - Danny Arends AU - Tõnu Esko AU - Marjolein J. Peters AU - Claudia Schurmann AU - Katharina Schramm AU - Johannes Kettunen AU - Hanieh Yaghootkar AU - Benjamin P. Fairfax AU - Anand Kumar Andiappan AU - Yang Li AU - Jingyuan Fu AU - Juha Karjalainen AU - Mathieu Platteel AU - Marijn Visschedijk AU - Rinse Weersma AU - Silva Kasela AU - Lili Milani AU - Liina Tserel AU - Pärt Peterson AU - Eva Reinmaa AU - Albert Hofman AU - André G. Uitterlinden AU - Fernando Rivadeneira AU - Georg Homuth AU - Astrid Petersmann AU - Roberto Lorbeer AU - Holger Prokisch AU - Thomas Meitinger AU - Christian Herder AU - Michael Roden AU - Harald Grallert AU - Samuli Ripatti AU - Markus Perola AU - Andrew R. Wood AU - David Melzer AU - Luigi Ferrucci AU - Andrew B. Singleton AU - Dena G. Hernandez AU - Julian C. Knight AU - Rossella Melchiotti AU - Bernett Lee AU - Michael Poidinger AU - Francesca Zolezzi AU - Anis Larbi AU - De Yun Wang AU - Leonard H. van den Berg AU - Jan H. Veldink AU - Olaf Rotzschke AU - Seiko Makino AU - Timouthy M. Frayling AU - Veikko Salomaa AU - Konstantin Strauch AU - Uwe Völker AU - Joyce B. J. van Meurs AU - Andres Metspalu AU - Cisca Wijmenga AU - Ritsert C. Jansen AU - Lude Franke Y1 - 2014/01/01 UR - http://biorxiv.org/content/early/2014/02/12/002600.abstract N2 - Expression quantitative trait locus (eQTL) mapping on tissue, organ or whole organism data can detect associations that are generic across cell types. We describe a new method to focus upon specific cell types without first needing to sort cells. We applied the method to whole blood data from 5,683 samples and demonstrate that SNPs associated with Crohn's disease preferentially affect gene expression within neutrophils. ER -