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Epidemic establishment and cryptic transmission of Zika virus in Brazil and the Americas
View ORCID ProfileN. R. Faria, J. Quick, I. Morales, J. Thézé, J.G. Jesus, M. Giovanetti, M. U. G. Kraemer, S. C. Hill, A. Black, A. C. da Costa, L.C. Franco, S. P. Silva, C.-H. Wu, J. Raghwani, S. Cauchemez, L. du Plessis, M. P. Verotti, W. K. de Oliveira, E. H. Carmo, G. E. Coelho, A. C. F. S. Santelli, L. C. Vinhal, C. M. Henriques, J. T. Simpson, M. Loose, K. G. Andersen, N. D. Grubaugh, S. Somasekar, C. Y. Chiu, J. E. Muñoz-Medina, C. R. Gonzalez-Bonilla, C. F. Arias, L. L. Lewis-Ximenez, S.A. Baylis, A. O. Chieppe, S. F. Aguiar, C. A. Fernandes, P. S. Lemos, B. L. S. Nascimento, H. A. O. Monteiro, I. C. Siqueira, M. G. de Queiroz, T. R. de Souza, J. F. Bezerra, M. R. Lemos, G. F. Pereira, D. Loudal, L. C. Moura, R. Dhalia, R. F. França, T. Magalhães, E. T. Marques Jr., T. Jaenisch, G. L. Wallau, M. C. de Lima, V. Nascimento, E. M. de Cerqueira, M. M. de Lima, D. L. Mascarenhas, J. P. Moura Neto, A. S. Levin, T. R. Tozetto-Mendoza, S. N. Fonseca, M. C. Mendes-Correa, F.P. Milagres, A. Segurado, E. C. Holmes, A. Rambaut, T. Bedford, M. R. T. Nunes, E. C. Sabino, L. C. J. Alcantara, N. Loman, O. G. Pybus
doi: https://doi.org/10.1101/105171
N. R. Faria
1Department of Zoology, University of Oxford, Oxford OX3 1PS, UK
2Evandro Chagas Institute, Ministry of Health, Ananindeua, Brazil
J. Quick
3Institute of Microbiology and Infection, University of Birmingham, UK
I. Morales
4Department of Infectious Disease, School of Medicine & Institute of Tropical Medicine, University of São Paulo, Brazil
J. Thézé
1Department of Zoology, University of Oxford, Oxford OX3 1PS, UK
J.G. Jesus
5Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ), Salvador, Bahia, Brazil
M. Giovanetti
5Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ), Salvador, Bahia, Brazil
6University of Rome Tor Vergata, Rome, Italy
M. U. G. Kraemer
1Department of Zoology, University of Oxford, Oxford OX3 1PS, UK
7Harvard Medical School, Boston, MA, USA
8Boston Children’s Hospital, Boston, MA, USA
S. C. Hill
1Department of Zoology, University of Oxford, Oxford OX3 1PS, UK
A. Black
9Vaccine and Infectious Disease Division, Fred Hutchinson Cancer Research Center, Seattle, WA, USA
10Department of Epidemiology, University of Washington, Seattle, WA, USA
A. C. da Costa
3Institute of Microbiology and Infection, University of Birmingham, UK
L.C. Franco
2Evandro Chagas Institute, Ministry of Health, Ananindeua, Brazil
S. P. Silva
2Evandro Chagas Institute, Ministry of Health, Ananindeua, Brazil
C.-H. Wu
11Department of Statistics, University of Oxford, Oxford OX3 1PS, UK
J. Raghwani
1Department of Zoology, University of Oxford, Oxford OX3 1PS, UK
S. Cauchemez
12Mathematical Modelling of Infectious Diseases and Center of Bioinformatics, Biostatistics and Integrative Biology, Institut Pasteur, Paris, France
13Centre National de la Recherche Scientifique, URA3012, Paris, France
L. du Plessis
1Department of Zoology, University of Oxford, Oxford OX3 1PS, UK
M. P. Verotti
14Coordenação dos Laboratórios de Saúde (CGLAB/DEVIT/SVS), Ministry of Health, Brasília, Brazil
W. K. de Oliveira
15Coordenação Geral de Vigilância e Resposta às Emergências em Saúde Pública (CGVR/DEVIT), Ministry of Health, Brasília, Brazil
16Center of Data and Knowledge Integration for Health (CIDACS), Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ), Brazil
E. H. Carmo
17Departamento de Vigilância das Doenças Transmissíveis, Ministry of Health, Brasilia, Brazil
G. E. Coelho
18Aedes, Brasília, Brazil
19Pan American Health Organization (PAHO), Buenos Aires, Argentina
A. C. F. S. Santelli
18Aedes, Brasília, Brazil
20Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ), Rio de Janeiro, Brazil
L. C. Vinhal
18Aedes, Brasília, Brazil
C. M. Henriques
17Departamento de Vigilância das Doenças Transmissíveis, Ministry of Health, Brasilia, Brazil
J. T. Simpson
21Ontario Institute for Cancer Research, Toronto, Canada
M. Loose
22University of Nottingham, Nottingham, UK
K. G. Andersen
23Department of Immunology and Microbial Science, The Scripps Research Institute, La Jolla, CA 92037, USA
N. D. Grubaugh
23Department of Immunology and Microbial Science, The Scripps Research Institute, La Jolla, CA 92037, USA
S. Somasekar
24Departments of Laboratory Medicine and Medicine & Infectious Diseases, University of California, San Francisco, USA
C. Y. Chiu
24Departments of Laboratory Medicine and Medicine & Infectious Diseases, University of California, San Francisco, USA
J. E. Muñoz-Medina
25División de Laboratorios de Vigilancia e Investigación Epidemiológica, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, Mexico
C. R. Gonzalez-Bonilla
25División de Laboratorios de Vigilancia e Investigación Epidemiológica, Instituto Mexicano del Seguro Social, Ciudad de México, Mexico
C. F. Arias
26Instituto de Biotecnología, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, Mexico
L. L. Lewis-Ximenez
27Instituto Oswaldo Cruz (FIOCRUZ), Rio de Janeiro, Brazil
S.A. Baylis
28Paul-Ehrlich-Institut, Langen, Germany
A. O. Chieppe
29Laboratório Central de Saúde Pública Noel Nutels, Rio de Janeiro, Brazil
S. F. Aguiar
29Laboratório Central de Saúde Pública Noel Nutels, Rio de Janeiro, Brazil
C. A. Fernandes
29Laboratório Central de Saúde Pública Noel Nutels, Rio de Janeiro, Brazil
P. S. Lemos
2Evandro Chagas Institute, Ministry of Health, Ananindeua, Brazil
B. L. S. Nascimento
2Evandro Chagas Institute, Ministry of Health, Ananindeua, Brazil
H. A. O. Monteiro
2Evandro Chagas Institute, Ministry of Health, Ananindeua, Brazil
I. C. Siqueira
5Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ), Salvador, Bahia, Brazil
M. G. de Queiroz
30Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Rio Grande do Norte, Natal, Brazil
T. R. de Souza
30Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Rio Grande do Norte, Natal, Brazil
31Universidade Potiguar do Rio Grande do Norte, Natal, Brazil
J. F. Bezerra
30Laboratório Central de Saúde Pública do Estado do Rio Grande do Norte, Natal, Brazil
32Faculdade Natalense de Ensino e Cultura, Rio Grande do Norte, Natal, Brazil
M. R. Lemos
33Laboratório Central de Saúde Pública do Estado da Paraíba, João Pessoa, Brazil
G. F. Pereira
33Laboratório Central de Saúde Pública do Estado da Paraíba, João Pessoa, Brazil
D. Loudal
33Laboratório Central de Saúde Pública do Estado da Paraíba, João Pessoa, Brazil
L. C. Moura
33Laboratório Central de Saúde Pública do Estado da Paraíba, João Pessoa, Brazil
R. Dhalia
34Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ), Recife, Pernambuco, Brazil
R. F. França
34Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ), Recife, Pernambuco, Brazil
T. Magalhães
34Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ), Recife, Pernambuco, Brazil
E. T. Marques Jr.
34Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ), Recife, Pernambuco, Brazil
35Center for Vaccine Research, Graduate School of Public Health, University of Pittsburgh, Pittsburgh, PA, USA
T. Jaenisch
36Section Clinical Tropical Medicine, Department for Infectious Diseases, Heidelberg University Hospital, Heidelberg, Germany
G. L. Wallau
34Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ), Recife, Pernambuco, Brazil
M. C. de Lima
37Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Alagoas, Maceió, Brazil
V. Nascimento
37Laboratório Central de Saúde Pública do Estado de Alagoas, Maceió, Brazil
E. M. de Cerqueira
38Universidade Estadual de Feira de Santana, Feira de Santana, Bahia, Brazil
M. M. de Lima
38Universidade Estadual de Feira de Santana, Feira de Santana, Bahia, Brazil
D. L. Mascarenhas
39Secretaria de Saúde de Feira de Santana, Feira de Santana, Bahia, Brazil
J. P. Moura Neto
40Universidade Federal do Amazonas, Manaus, Brazil
A. S. Levin
4Department of Infectious Disease, School of Medicine & Institute of Tropical Medicine, University of São Paulo, Brazil
T. R. Tozetto-Mendoza
4Department of Infectious Disease, School of Medicine & Institute of Tropical Medicine, University of São Paulo, Brazil
S. N. Fonseca
41Hospital São Francisco, Ribeirão Preto, Brazil
M. C. Mendes-Correa
4Department of Infectious Disease, School of Medicine & Institute of Tropical Medicine, University of São Paulo, Brazil
F.P. Milagres
42Universidade Federal do Tocantins, Palmas, Brazil
A. Segurado
4Department of Infectious Disease, School of Medicine & Institute of Tropical Medicine, University of São Paulo, Brazil
E. C. Holmes
43University of Sydney, Sydney, Australia
A. Rambaut
44Institute of Evolutionary Biology, University of Edinburgh, Edinburgh EH9 3FL, UK
45Fogarty International Center, National Institutes of Health, Bethesda, MD 20892, USA
T. Bedford
7Harvard Medical School, Boston, MA, USA
M. R. T. Nunes
2Evandro Chagas Institute, Ministry of Health, Ananindeua, Brazil
46Department of Pathology, University of Texas Medical Branch, Galveston, TX 77555, USA
E. C. Sabino
4Department of Infectious Disease, School of Medicine & Institute of Tropical Medicine, University of São Paulo, Brazil
L. C. J. Alcantara
5Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ), Salvador, Bahia, Brazil
N. Loman
3Institute of Microbiology and Infection, University of Birmingham, UK
O. G. Pybus
1Department of Zoology, University of Oxford, Oxford OX3 1PS, UK
47Metabiota, San Francisco, CA 94104, USA
Article usage
Posted March 27, 2017.
Epidemic establishment and cryptic transmission of Zika virus in Brazil and the Americas
N. R. Faria, J. Quick, I. Morales, J. Thézé, J.G. Jesus, M. Giovanetti, M. U. G. Kraemer, S. C. Hill, A. Black, A. C. da Costa, L.C. Franco, S. P. Silva, C.-H. Wu, J. Raghwani, S. Cauchemez, L. du Plessis, M. P. Verotti, W. K. de Oliveira, E. H. Carmo, G. E. Coelho, A. C. F. S. Santelli, L. C. Vinhal, C. M. Henriques, J. T. Simpson, M. Loose, K. G. Andersen, N. D. Grubaugh, S. Somasekar, C. Y. Chiu, J. E. Muñoz-Medina, C. R. Gonzalez-Bonilla, C. F. Arias, L. L. Lewis-Ximenez, S.A. Baylis, A. O. Chieppe, S. F. Aguiar, C. A. Fernandes, P. S. Lemos, B. L. S. Nascimento, H. A. O. Monteiro, I. C. Siqueira, M. G. de Queiroz, T. R. de Souza, J. F. Bezerra, M. R. Lemos, G. F. Pereira, D. Loudal, L. C. Moura, R. Dhalia, R. F. França, T. Magalhães, E. T. Marques Jr., T. Jaenisch, G. L. Wallau, M. C. de Lima, V. Nascimento, E. M. de Cerqueira, M. M. de Lima, D. L. Mascarenhas, J. P. Moura Neto, A. S. Levin, T. R. Tozetto-Mendoza, S. N. Fonseca, M. C. Mendes-Correa, F.P. Milagres, A. Segurado, E. C. Holmes, A. Rambaut, T. Bedford, M. R. T. Nunes, E. C. Sabino, L. C. J. Alcantara, N. Loman, O. G. Pybus
bioRxiv 105171; doi: https://doi.org/10.1101/105171
Epidemic establishment and cryptic transmission of Zika virus in Brazil and the Americas
N. R. Faria, J. Quick, I. Morales, J. Thézé, J.G. Jesus, M. Giovanetti, M. U. G. Kraemer, S. C. Hill, A. Black, A. C. da Costa, L.C. Franco, S. P. Silva, C.-H. Wu, J. Raghwani, S. Cauchemez, L. du Plessis, M. P. Verotti, W. K. de Oliveira, E. H. Carmo, G. E. Coelho, A. C. F. S. Santelli, L. C. Vinhal, C. M. Henriques, J. T. Simpson, M. Loose, K. G. Andersen, N. D. Grubaugh, S. Somasekar, C. Y. Chiu, J. E. Muñoz-Medina, C. R. Gonzalez-Bonilla, C. F. Arias, L. L. Lewis-Ximenez, S.A. Baylis, A. O. Chieppe, S. F. Aguiar, C. A. Fernandes, P. S. Lemos, B. L. S. Nascimento, H. A. O. Monteiro, I. C. Siqueira, M. G. de Queiroz, T. R. de Souza, J. F. Bezerra, M. R. Lemos, G. F. Pereira, D. Loudal, L. C. Moura, R. Dhalia, R. F. França, T. Magalhães, E. T. Marques Jr., T. Jaenisch, G. L. Wallau, M. C. de Lima, V. Nascimento, E. M. de Cerqueira, M. M. de Lima, D. L. Mascarenhas, J. P. Moura Neto, A. S. Levin, T. R. Tozetto-Mendoza, S. N. Fonseca, M. C. Mendes-Correa, F.P. Milagres, A. Segurado, E. C. Holmes, A. Rambaut, T. Bedford, M. R. T. Nunes, E. C. Sabino, L. C. J. Alcantara, N. Loman, O. G. Pybus
bioRxiv 105171; doi: https://doi.org/10.1101/105171
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- Biochemistry (11753)
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- Paleontology (451)
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- Zoology (1651)