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Ancestral genome reconstruction reveals the history of ecological diversification in Agrobacterium
Florent Lassalle, Rémi Planel, Simon Penel, David Chapulliot, Valérie Barbe, Audrey Dubost, Alexandra Calteau, David Vallenet, Damien Mornico, Laurent Guéguen, Ludovic Vial, Daniel Muller, Vincent Daubin, Xavier Nesme
doi: https://doi.org/10.1101/034843
Florent Lassalle
1Université de Lyon, F-69622 Lyon, France
2Université Lyon 1, Villeurbanne, France
3CNRS, UMR5557, Ecologie Microbienne, Villeurbanne, France
4INRA, UMR 1418, Ecologie Microbienne, Villeurbanne, France
5CNRS, UMR5558 Biométrie et Biologie Evolutive, Villeurbanne, France
6Ecole Normale Supérieure de Lyon, 69342 Lyon, France
Rémi Planel
1Université de Lyon, F-69622 Lyon, France
2Université Lyon 1, Villeurbanne, France
5CNRS, UMR5558 Biométrie et Biologie Evolutive, Villeurbanne, France
Simon Penel
1Université de Lyon, F-69622 Lyon, France
2Université Lyon 1, Villeurbanne, France
5CNRS, UMR5558 Biométrie et Biologie Evolutive, Villeurbanne, France
David Chapulliot
1Université de Lyon, F-69622 Lyon, France
2Université Lyon 1, Villeurbanne, France
3CNRS, UMR5557, Ecologie Microbienne, Villeurbanne, France
4INRA, UMR 1418, Ecologie Microbienne, Villeurbanne, France
Valérie Barbe
7Direction des Sciences du Vivant, Commissariat à l’Energie Atomique et aux Energies Alternatives (CEA), Institut de Génomique, Genoscope, 2 rue Gaston Crémieux, Evry F-91057, France.
Audrey Dubost
1Université de Lyon, F-69622 Lyon, France
2Université Lyon 1, Villeurbanne, France
3CNRS, UMR5557, Ecologie Microbienne, Villeurbanne, France
Alexandra Calteau
7Direction des Sciences du Vivant, Commissariat à l’Energie Atomique et aux Energies Alternatives (CEA), Institut de Génomique, Genoscope, 2 rue Gaston Crémieux, Evry F-91057, France.
8CNRS, UMR 8030, Laboratoire d’Analyse Bioinformatiques pour la Génomique et le Métabolisme, 2 rue Gaston Crémieux, 91057 Evry, France
9UEVE, Université d’Evry Val d’Essonne, boulevard François Mitterrand, 91025 Evry, France
David Vallenet
7Direction des Sciences du Vivant, Commissariat à l’Energie Atomique et aux Energies Alternatives (CEA), Institut de Génomique, Genoscope, 2 rue Gaston Crémieux, Evry F-91057, France.
8CNRS, UMR 8030, Laboratoire d’Analyse Bioinformatiques pour la Génomique et le Métabolisme, 2 rue Gaston Crémieux, 91057 Evry, France
9UEVE, Université d’Evry Val d’Essonne, boulevard François Mitterrand, 91025 Evry, France
Damien Mornico
7Direction des Sciences du Vivant, Commissariat à l’Energie Atomique et aux Energies Alternatives (CEA), Institut de Génomique, Genoscope, 2 rue Gaston Crémieux, Evry F-91057, France.
8CNRS, UMR 8030, Laboratoire d’Analyse Bioinformatiques pour la Génomique et le Métabolisme, 2 rue Gaston Crémieux, 91057 Evry, France
9UEVE, Université d’Evry Val d’Essonne, boulevard François Mitterrand, 91025 Evry, France
Laurent Guéguen
1Université de Lyon, F-69622 Lyon, France
2Université Lyon 1, Villeurbanne, France
5CNRS, UMR5558 Biométrie et Biologie Evolutive, Villeurbanne, France
Ludovic Vial
1Université de Lyon, F-69622 Lyon, France
2Université Lyon 1, Villeurbanne, France
3CNRS, UMR5557, Ecologie Microbienne, Villeurbanne, France
Daniel Muller
1Université de Lyon, F-69622 Lyon, France
2Université Lyon 1, Villeurbanne, France
3CNRS, UMR5557, Ecologie Microbienne, Villeurbanne, France
Vincent Daubin
1Université de Lyon, F-69622 Lyon, France
2Université Lyon 1, Villeurbanne, France
5CNRS, UMR5558 Biométrie et Biologie Evolutive, Villeurbanne, France
Xavier Nesme
1Université de Lyon, F-69622 Lyon, France
2Université Lyon 1, Villeurbanne, France
3CNRS, UMR5557, Ecologie Microbienne, Villeurbanne, France
4INRA, UMR 1418, Ecologie Microbienne, Villeurbanne, France
Article usage
Posted January 13, 2016.
Ancestral genome reconstruction reveals the history of ecological diversification in Agrobacterium
Florent Lassalle, Rémi Planel, Simon Penel, David Chapulliot, Valérie Barbe, Audrey Dubost, Alexandra Calteau, David Vallenet, Damien Mornico, Laurent Guéguen, Ludovic Vial, Daniel Muller, Vincent Daubin, Xavier Nesme
bioRxiv 034843; doi: https://doi.org/10.1101/034843
Ancestral genome reconstruction reveals the history of ecological diversification in Agrobacterium
Florent Lassalle, Rémi Planel, Simon Penel, David Chapulliot, Valérie Barbe, Audrey Dubost, Alexandra Calteau, David Vallenet, Damien Mornico, Laurent Guéguen, Ludovic Vial, Daniel Muller, Vincent Daubin, Xavier Nesme
bioRxiv 034843; doi: https://doi.org/10.1101/034843
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